وتضم خمساً وعشرين كلية, تتوزع كليات جامعة الفرات في محافظات (دير الزور ـ الحسكة ـ الرقة)على النحو الآتي :
1. محافظة دير الزور وتضم احدى عشرة كلية وهي :
(الطب البشري - الهندسة البتروكيميائية- الزراعة- العلوم - الحقوق - الاقتصاد - الآداب والعلوم الإنسانية - التربية – الطب البيطري- التمريض - الهندسة الميكانيكية والكهربائية).
2. محافظة الحسكة وتضم ثماني كليات وهي :
(الهندسة المدنية-ـ الهندسة الزراعية - الحقوق - العلوم - الآداب والعلوم الإنسانية -ـ التربية - الاقتصاد- طب الأسنان).
3. محافظة الرقة وتضم ست كليات وهي :
(الهندسة المدنية - الآداب والعلوم الإنسانية - العلوم – التربية- الزراعة - الصيدلة).