أجري البحث خلال الفترة الممتدة من شهر نيسان 2019 إلى شهر حزيران 2020 م بهدف تحديد التركيب النوعي والكمي للفاونا السمكية في نهر الفرات – محافظة دير الزور في الوضع الراهن ودراسة الأسباب التي أدت لإنقراض بعض الأنواع السمكية في نهر الفرات، إذ تم جمع العينات السمكية من ثلاثة مواقع من نهر الفرات وهي: المريعية، الحسينية، البغيلية، و بلغ العدد الإجمالي للعينات المجموعة (673) فرداً من الأسماك. أظهرت نتائج الدراسة الحقلية والمخبرية وجود 16 نوعاً سمكياً وهي: 11 نوع تنتمي إلى فصيلة Cyprinidae، ونوع واحد ينتمي إلى فصيلة Cichlidae، ونوع ينتمي إلى فصيلة Mugilidae، ونوع ينتمي إلى فصيلة Siluridae، ونوع ينتمي إلى فصيلة Clariidae، ونوع ينتمي إلى فصيلة Sisoridae، ونوع ينتمي إلى Mastace mbelidae. وتعود هذه الأنواع إلى 13 جنساً مختلفاً, وتبين إن المطواق Aspius vorax كان أكثر الأنواع اصطياداً في مياه النهر ضمن منطقة الدراسة، وهو من الأسماك الأصيلة في نهر الفرات ومن الأسماك المفترسة التي تتغذى على غيرها من الأسماك, وكان موقع المريعية الأكثر غنىً بالفاونا السمكية من حيث الكم والنوع. كما دلت نتائج الدراسة الحالية على حدوث تناقص في إعداد الأنواع السمكية المستوطنة في النهر, ومواقع الدراسة وكمياتها بالمقارنة مع دراسات سابقة، وذلك بسبب إنخفاض منسوب المياه وزيادة تلوثه من الصرف الصحي والزراعي والتلوث النفطي والصيد الجائر في موسم التكاثر واستخدام وسائل الصيد الغير مشروعة كالصيد الكهربائي والأنواع المختلفة من السموم القاتلة ما يشير هذا إلى تدهور الفاونا السمكية.